近期，《呼吸道感染病原体分级检测策略与分层应用专家共识（2026 版）》于《中华检验医学杂志》正式发布。由呼吸系统疾病国家临床医学研究中心、中华医学会检验医学分会牵头，集合检验、呼吸危重症、感染、儿科多学科专家，构建起一套阶梯式、分级分层的呼吸道感染病原检测新范式，直面临床痛点，形成 17 条推荐意见，引导临床该查才查、逐级升级，拒绝盲目大检测、大测序。

新版共识确立总体技术定位：常规微生物学检测为基础，核酸扩增检测 (NAAT) 为主干，免疫学检测为补充，tNGS/mNGS 作为疑难、危重、免疫低下人群的高阶手段。

阶梯式病原学检测路径

共识系统梳理了常见检测技术的特点与临床定位，强调不存在单一技术的 "万能方案"，各类方法在 TAT、敏感度、可及性和成本上各有优势与局限，需依据临床场景合理选用。

传统微生物学丨基础层

TAT：细菌 48-96 小时；真菌 > 5 天

优势：明确致病活菌种类；提供表型药敏依据

局限：周期长；苛养菌培养困难；受标本质量及抗菌药物暴露影响

定位：细菌、真菌感染诊断及耐药监测

qPCR 丨主干层・NAAT

TAT：2-4 小时

优势：技术成熟、性能稳定；全自动平台可实现 "样本进、结果出"

局限：仅能检测预设靶标；跨系统 Ct 值不可直接比较

定位：目标病原明确时的一线分子检测

核酸 POCT 丨主干层・NAAT

TAT：15-60 分钟

优势：操作简便，可下沉至临床科室及床旁

局限：通量有限；靶标固定；去中心化检测存在质控和生物安全隐患

定位：发热门诊、急诊、ICU 的即时分子诊断

多重 PCR 丨主干层・NAAT

TAT：1-3 小时

优势：单次检测可覆盖常见病原群及耐药基因，减少重复送检

局限：低载量阳性和定植解释复杂

定位：SCAP、HAP/VAP 及经验治疗效果不佳者的病原筛查

抗原检测丨补充层・免疫学

TAT：15-30 分钟

优势：简便快捷；高病原载量时阳性具有诊断参考价值

局限：敏感度低于 NAAT；阴性不能排除感染

定位：流行季门急诊分流、基层初筛

抗体检测丨补充层・免疫学

TAT：0.5-4 小时

优势：血液样本易获取；可与核酸互补覆盖病程不同阶段

局限：存在窗口期；免疫低下者易假阴性；难区分现症与既往感染

定位：特定病原体感染病程中后期的辅助诊断；双份血清回顾性诊断

tNGS 丨高阶层・高通量测序

TAT：12-24 小时

优势：病原谱广；宿主干扰少；兼顾部分耐药基因

局限：检测范围受预设靶标限制；耐药基因检出≠表型耐药

定位：常规检测阴性但高度疑似感染时的二线扩展筛查

mNGS 丨高阶层・高通量测序

TAT：24-72 小时

优势：无偏倚检测，可识别罕见、新发、未知病原体

局限：流程复杂；宿主背景干扰大；生信解读需结合临床

定位：疑难、危重、ICH 患者复杂感染及不明原因感染的补充诊断

不同临床场景分层应用

门急诊流感样病例 (ILI)

流行季优先针对核心流行病原体的核酸 POCT 或抗原检测；老年人（≥65 岁）、高危儿童（早产儿、6 月龄以下婴儿、有基础疾病或免疫缺陷者）、合并慢性基础疾病者、孕产妇及拟住院患者等高危人群可酌情放宽多重 PCR 指征；不常规推荐测序。

住院社区获得性肺炎 (CAP)

入院 24 小时内、经验性抗感染治疗前完成基线病原学评估；优先传统微生物学＋选择性 NAAT；经验性治疗 48-72 小时疗效欠佳或病情进展者再按阶梯升级。

重症 CAP (SCAP)

尽早同步传统微生物学＋多重 PCR＋tNGS/mNGS，并送检血培养，覆盖病毒、细菌、真菌以及耐药基因，避免逐项等待结果后再升级。

医院获得性肺炎／呼吸机相关性肺炎 (HAP/VAP)

尽早同步传统微生物学＋多重 PCR＋tNGS/mNGS，并送检血培养，覆盖病毒、细菌、真菌以及耐药基因，避免逐项等待结果后再升级。

免疫功能低下宿主 (ICH) 合并呼吸道感染 (RTI)

早期广谱筛查，优先 BALF mNGS 并同步送检血培养；机会性病原体（如耶氏肺孢子菌、曲霉菌）需结合临床、影像学及特异性 qPCR 多维度确证，区分定植与侵袭性感染。

部分推荐意见

推荐意见 1（强推荐）

拟住院治疗并准备启动经验性抗感染治疗的 RTI 患者，尤其 SCAP、HAP/VAP 及 ICH，应在经验性抗感染治疗前留取合格的下呼吸道标本，首选 BALF，对不能耐受支气管镜检查者可采用诱导痰替代；对 SCAP 患者及其他疑似合并血流感染者，应同步规范采集血培养（经不同部位独立静脉穿刺，至少 2 套）。

推荐意见 2（强推荐）

方法选择应结合临床场景、检测目的与检测可及性。具备条件者优先采用核酸检测；不具备条件时，流行季可用抗原检测快速筛查，阳性具有诊断参考价值，阴性不能排除感染；抗原阴性但临床高度怀疑者应行核酸复核；无法立即送检时建议在 24~48h 内完成。

推荐意见 6（强推荐）

对 SCAP、HAP/VAP 及经验治疗效果不佳者，优先采用多重 PCR／症候群组合检测，覆盖常见病原体和耐药基因，减少重复送检；结果需与标本类型、临床表型及传统微生物学检测联合解读。

推荐意见 7（条件推荐）

tNGS/mNGS 不适用于门急诊轻症常规筛查；对常规治疗反应不佳或常规检测阴性但临床高度怀疑感染者，经标本质量、病程阶段、宿主风险及非感染性病因综合评估后，按 “常规 NAAT - 多重 PCR-tNGS/mNGS” 的路径升级检测；对急危重症患者或 ICH，若病情进展较快或高度怀疑罕见、混合感染，可跨越阶梯限制早期启用 tNGS/mNGS。

推荐意见 8（强推荐）

疑似肺结核、侵袭性肺曲霉病等特定病原感染时，应优先遵循特定疾病检测路径；高通量测序结果需与分子检测、涂片、培养、血清学标志物、病理或临床标准交叉验证，不宜替代特定疾病诊断标准。

推荐意见 9（强推荐）

基层医疗卫生机构应具备血常规、CRP 等基础检验及抗原初筛能力，具备条件者可开展核酸 POCT 以支持分流决策；二级医院应常规开展传统微生物学、分子检测及 PCT 监测；三级医院应建立涵盖多重 PCR 及高通量分子诊断、疑难病原鉴定及宿主免疫评估的综合检测平台，常态化开展 MDT。各级机构应以指征为导向，避免高阶平台盲目配置与检测项目重复叠加。

推荐意见 12（强推荐）

HAP/VAP 患者应在合格下呼吸道标本规范微生物学检测的同时，早期同步加做针对 MDRO 及关键耐药基因的多重 PCR 检测；表型药敏结果出具前，若分子检测提示与临床高度相关的 MDRO 关键耐药基因（如 blaKPC、blaNDM、mecA 等）强阳性，可据具体酶型／耐药基因作为早期经验性调整或升级抗菌药物的依据；不宜仅凭分子检测阴性结果降阶使用或停用关键抗菌药物，最终治疗决策以规范的表型药敏试验结果为准；未能明确病原且病情持续恶化者，经 MDT 评估后审慎启动 mNGS。

推荐意见 13（强推荐）

ICH 合并 RTI 时建议早期开展广谱病原学筛查，优先推荐 BALF mNGS 并同步送检血培养。无法获取呼吸道标本或疑有血行播散感染时，可加做外周血血浆 cfDNA mNGS，与血培养同步采集、规范处理以降低假阴性；但其敏感度低于 BALF mNGS，且对胞内及颗粒性病原体可能漏检，检测结果应结合血清学标志物综合解读；对检出的机会性病原体（如耶氏肺孢子菌、曲霉菌等）应结合临床、影像学及特异性 qPCR 等进行多维度确证，鉴别定植与感染；CMV、EBV 等 DNA 病毒须结合血浆病毒 DNA 载量动态监测与组织病理学结果，鉴别潜伏感染再激活与侵袭性感染。

各级医疗机构能力分层建设

基层／居家

能力定位：初筛、分流，识别高危患者及时转诊

检测配置：血常规、CRP + 抗原检测；条件许可配置核酸 POCT

二级医院

能力定位：规范化诊疗，落实抗感染前病原送检

检测配置：传统微生物 + 常规核酸检测；规范化测序外送 + 结果回溯

三级医院

能力定位：疑难危重症兜底，区域技术支撑

检测配置：多重 PCR+tNGS/mNGS + 疑难病原鉴定 + 耐药检测；宿主免疫评估；常态化开展 MDT

卓诚惠生全场景检测方案

卓诚惠生依托多重荧光 PCR、免疫层析等多维技术平台，覆盖病毒、细菌、真菌及非典型病原体，与共识分级检测理念高度契合。从基层抗原初筛到重症多重 PCR 全覆盖，形成完整的阶梯式检测方案，助力临床快速精准明确病原，支持目标性抗感染治疗。

共识场景丨门急诊 ILI

呼吸道病原体抗原多重检测试剂盒（胶体金法）（甲型流感病毒 / 乙型流感病毒 / 呼吸道合胞病毒 / 腺病毒 / 肺炎支原体）

呼吸道病毒核酸六重联检试剂盒（PCR 荧光探针法）（甲型流感病毒 / 乙型流感病毒 / 副流感病毒 I+III / 呼吸道合胞病毒 / 腺病毒）

鼻病毒 / 博卡病毒 / 偏肺病毒核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

肺炎支原体 / 百日咳杆菌核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

共识场景丨 CAP 住院 / SCAP

肺炎链球菌 / 流感嗜血杆菌 / 卡他莫拉菌核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

呼吸道病毒核酸六重联检试剂盒（PCR 荧光探针法）（甲型流感病毒 / 乙型流感病毒 / 副流感病毒 I+III / 呼吸道合胞病毒 / 腺病毒）鼻病毒 / 博卡病毒 / 偏肺病毒核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

肺炎支原体 / 百日咳杆菌核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

共识场景丨 HAP/VAP

肺炎克雷伯菌 / 铜绿假单胞菌 / 鲍曼不动杆菌核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

洋葱伯克霍尔德菌复合体 / 大肠埃希氏菌 / 阴沟肠杆菌复合体核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

共识场景丨 ICH 合并 RTI

曲霉菌属、新型隐球菌及耶氏肺孢子菌核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

曲霉菌属核酸检测试剂盒（PCR 荧光探针法）

病毒 / 非典型病原体核酸检测产品系列

细菌核酸检测产品系列

参考文献：

[1] 呼吸系统疾病国家临床医学研究中心，中华医学会检验医学分会，广东省研究型医院学会检验医学转化与发展专业委员会。呼吸道感染病原体分级检测策略与分层应用专家共识（2026 版）. 中华检验医学杂志，2026，49 (09):1069-1082. DOI:10.3760/cma.j.cn114452-20260515-00323